Thủ tục hoàn thuế nộp thừa do hủy tờ khai như thế nào?

Ảnh minh họa. Nguồn: internet

Cụ thể, theo phản ánh của Công ty TNHH MTV Kaneshiro Việt Nam, "Công ty có nộp thừa thuế nhập khẩu và thuế GTGT tại Chi cục Hải quan CK Sài Gòn KV 1 do hủy tờ khai. Để hoàn lại số thuế đã nộp cho tờ khai bị hủy này, công ty không biết thực hiện thủ tục như thế nào?"

Căn cứ khoản 12 Điều 112 Thông tư 128/2013/TT-BTC ngày 10-9-2013 của Bộ Tài chính quy định các trường hợp hoàn thuế nhập khẩu gồm: Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu đã nộp thuế nhưng sau đó được miễn thuế, hoàn thuế theo quyết định của cơ quan nhà nước có thẩm quyền thì được hoàn thuế. Hồ sơ, thủ tục hoàn thuế được quy định tại Điều 26 Thông tư 128/2013/TT-BTC ngày 10-9-2013 của Bộ Tài chính.

Bên cạnh đó, điểm 1 công văn 5554/TCHQ-TXNK ngày 19-5-2014 của Tổng cục Hải quan hướng dẫn hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu nộp thừa có quy định: Trường hợp người nộp thuế nộp nhầm, nộp thừa thuế GTGT hàng nhập khẩu cho cơ quan Hải quan trong năm ngân sách, trước khi kết thúc thời hạn chỉnh lý quyết toán ngân sách Nhà nước năm đó mà người nộp thuế hoặc cơ quan Hải quan phát hiện thì thực hiện điều chỉnh thu ngân sách Nhà nước theo mẫu C1-07/NS ban hành kèm theo Quyết định số 759/QĐ-BTC ngày 16-4-2013 về việc đính chính Thông tư số 08/2013/TT-BTC ngày 10/01/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn thực hiện kế toán Nhà nước áp dụng cho Hệ thống thông tin quản lý ngân sách và Kho bạc (TABMIS).

Đồng thời, người nộp thuế nộp bản chính Giấy nộp tiền vào ngân sách Nhà nước, cơ quan Hải quan xác nhận, ký tên, đóng dấu đơn vị lên mặt trước bản chính của Giấy nộp tiền vào ngân sách Nhà nước số tiền thuế GTGT điều chỉnh sang khoản thuế khác để chuyển Kho bạc Nhà nước hạch toán điều chỉnh thu ngân sách Nhà nước.

Trường hợp khoản thuế GTGT hàng nhập khẩu đã nộp, được hoàn trả ngoài năm ngân sách: Cơ quan Hải quan nơi người nhập khẩu mở tờ khai tiếp nhận hồ sơ đề nghị hoàn thuế, ban hành quyết định hoàn tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa theo mẫu đính kèm, lập lệnh hoàn trả khoản thu NSNN (theo mẫu 01/LHT: Lệnh hoàn trả khoản thu ngân sách Nhà nước ban hành kèm theo Thông tư số 28/2011/TT-BTC ngày 28-2-2011 của Bộ Tài chính) gửi Kho bạc Nhà nước nơi đã hạch toán thu NSNN đối với khoản thuế GTGT hàng nhập khẩu nộp thừa để thực hiện chi ngân sách và hoàn trả cho người nộp thuế theo quy định.

Cơ quan Hải quan có trách nhiệm gửi một bản quyết định hoàn thuế vành lệnh hoàn trả khoản thu NSNN nêu trên cho cơ quan Thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế để làm cơ sở đối chiếu và thu hồi số thuế GTGT đã khấu trừ hoặc hoàn thuế khâu nội địa (nếu có) của các chứng từ nộp thuế đã được điều chỉnh hoặc hoàn thuế tại cơ quan Hải quan theo quy định.

Người nộp thuế có trách nhiệm tự kê khai điều chỉnh số thuế GTGT đã được cơ quan Hải quan hoàn nhưng đã kê khai, khấu trừ hoặc đã được hoàn thuế nội địa trước đó với cơ quan Thuế trực tiếp quản lý người nộp thuế.

Đề nghị Công ty tham khảo các quy định nêu trên và liên hệ trực tiếp với chi cục hải quan nơi làm thủ tục để được xem xét, giải quyết hoàn thuế NK, GTGT mà công ty đã nộp thừa nêu trên.